大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于国家自然科学基金 lncRNA研究项目的问题,于是小编就整理了3个相关介绍国家自然科学基金 lncRNA研究项目的解答,让我们一起看看吧。
lncrna全称?
lncRNA,全称“长链非编码RNA”(long non-coding RNA),是近年来RNA方向的研究热门。
以前只是各种听说,没正儿八经地做过lncRNA的测序分析。最近接到新任务,所以来了解了解,本人实在健忘,所以记下lncRNA的基础信息。
lncRNA特点?
1)长度在200-100000nt之间的RNA分子;
2)具有mRNA样结构,有polyA尾巴和启动子样结构;
3)不编码蛋白。
在生信分析中,往往会去除
有蛋白编码家族的转录本;
去除有编码能力的RNA来筛选lncRNA;(工具:CPAT,CNCI,CPC,PLEK)
为什么lncRNA要***用链特异性建库?
为什么lncrna称为非编码rna?
lncRNA是长链非编码RNA的简称,是长度在200-100000 nt之间的RNA分子。大多数的lncRNAs在组织分化发育过程中,都具有明显的时空表达特异性;序列上保守性较低,只有约12%的lncRNA可在人类之外的其它生物中找到。
非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA,包括miRNA、lncRNA、circRNA、piRNA等。非编码RNA发挥功能的方式很多,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种细胞活动,主要包括基因的激活和沉默,RNA的剪接、修饰和编辑,蛋白质的翻译等。
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。
lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究表明,lncRNA参与了X染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录激活,转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA(相应的蛋白编码RNA的比例是1%),虽然近年来关于lncRNA的研究进展迅猛,但是绝大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的。
如何利用tcga数据库进行差异的lncrna分析?
DataTable dt = new DataTable()
;dt.Columns.Add(new DataColumn("PreRevDate0", typeof(decimal)))
;DataColumn col = new DataColumn()
;col.ColumnName = "PreRevDate1"
;col.Expression = "ABS(Convert.ToInt32(PreRevDate0))"
;col.DataType = typeof(decimal)
;dt.Columns.Add(col)
;DataRow dr = dt.NewRow()
;dr["PreRevDate0"] = -1;dt.Rows.Add(dr);
到此,以上就是小编对于国家自然科学基金 lncRNA研究项目的问题就介绍到这了,希望介绍关于国家自然科学基金 lncRNA研究项目的3点解答对大家有用。